داروهای پیشگیری و داروهای مصرفی به هنگام بروز حملات میگرنی عوارض جانبی قابل توجهی دارند. به‌علاوه آنکه معروف‌ترین آنها خانواده‌ی سوماتریپتان به‌خاطر مکانیسم عمل‌شان که کاهش قطر عروق است ، در  بیماران مبتلا به فشار خون و گرفتگی عروق (بیماری‌های شایع در جهان و ایران) منع مصرف دارند. از عوارض جانبی هر دو دسته‌ی دارویی می‌توان به تهوع، استفراغ، افسردگی، یبوست، درد‌های شکمی، تنگی نفس، بی‌حسی، سوزش انگشتان دست و پا، درد عضلانی در اندام‌های تحتانی و ضعف در پاها اشاره کرد.